听了甘辉的话后，郑成功默思良久，然后说：“尔言固是，但我见阵中旗帜未接即退者，此等不儆，将何以治兵？”当时右翼将领中，除了四位战死之外，亢宿营营官林德、右冲镇将领柯鹏擅自退兵。林德是最早撤退的将领，郑成功下令将他处死，柯鹏捆责削职，并优恤阵亡将领的家眷，并将这些阵亡将领的牌位迎入忠臣庙祭享。
郑军在古县战败后，郑成功返回厦门岛。此时闽南的局势对郑成功十分不利，清军乘机收复了南靖、漳浦、平和、诏安四座县城，这些地方是郑军重要的粮饷来源，所以郑成功派遣黄兴为正提调，万礼为副提调，率中权镇、前冲镇、护卫前镇、护卫后镇等前往诏安、平和等地略地筹粮。
十二月，黄兴等人率军到平和境内筹粮，被清军所侦知，清军马上派出三位将领带着骑兵、步兵数千人前来，兵分三路，跟踪追击。黄兴、万礼决定将计就计，以伏击战歼灭来犯的清军。
一路清军追踪黄兴到一处山岭地带，黄兴便占据险要之地，设下伏兵，清军一路猛进，被逮了个正着，黄兴的伏兵杀出，清军逃荒而逃。另一路的清军运气更差了，追击郑军到了一个叫松柏坑的地方，万礼早在此设下伏兵，闯进口袋阵中的清军全军覆没，无一人逃脱。郑军的反戈一击，令金砺明白，虽然遭遇古县之败，郑军的战斗力仍然未可小觑。
郑成功对粮饷极其重视，这是他得以生存与发展的重要原因，同时在军纪上之严酷也是有名的。黄兴、万礼等率数镇兵力到诏安筹集粮饷后，于1653年二月擅自返回厦门岛，郑成功愤怒地责问说：“未闻帅令，擅自归回，是欲何为？”下令调查谁提出要返回，结果查出来乃是部将王怡、若骥二人的主意，结果郑成功下令将王怡处死，将若骥捆责革职。黄兴、万礼等将领也同样遭到降级处分。
永历六年，是南明史中非常不平凡的一年，郑军开始显示出强大的战斗力，在福建南部攻城掠地，歼灭数万名清军，郑成功以强人的姿态倔强地崛起于东南沿海地区，成为清政府的心腹之患。同时，在西南方向，李定国以坚强的意志与才华横溢的军事才能，横扫清军，这里，我们来回顾一下广州失陷后，西南抗清的形势变化。
永历四年十一月，广州、桂林相续失守，永历帝无兵无将，只得选择与大西军的合作，孙可望派五千人马入南宁保护永历帝，继而又得到梦寐已久的"秦王"称号，并将永历帝迎入贵州安隆，大西军与南明的结合，开始了一个抗清运动的新高潮。
1652年，大西军兵分两路，大举出击，一路由刘文秀统率六万人马，攻叙州、泸州、破重庆，占成都，但在保宁之战中，被吴三桂的清军所击败；另一路由李定国统率八万步、骑兵与象兵，由川东入湖南，连下沅州、靖州、武冈、宝庆，在攻占全州后，李定国挥师急趋桂林，七月四日，攻破桂林，清定南王孔有德自焚身亡，南明叛将陈邦傅被生擒。此役实为南明抗清以来所未曾有之辉煌胜利。之后李定国大军再收复平乐、梧州、柳州、南宁诸地。九月挥师北上，夺永州、衡州，略岳州，横扫湖南。十一月，清定远大将军尼堪率十余万入湖南，攻衡州，李定国设伏兵，阵斩尼堪，再度震惊清廷。
